Sekirei son 108 hermosas chicas de origen desconocido, que junto con sus Ashikabi (humanos asociados), deben luchar entre sí para determinar quién subirá y reclamar el “premio”. ¿Cuál es el propósito principal de este evento? ¿Cuáles son los planes del creador del evento?

Sasashi Minato es un chico de 19 años, que estudia su segundo año de escuela. Un día justo regresando a casa, literalmente le cae del cielo una chica, su nombre es Musubi. Musubi es una chica linda, dulce, enérgica y sobre todo muy sexy. Apartir de su llegada (o caída) la vida de Minato cambiara por completo, ya que será la primera vez qué él vivirá con una chica en su vida, aunando que extraños acontecimientos empezaran a darle un giro radical a su tranquila vida de estudiante.